相对于“世界三大饮料植物”中的咖啡和可可而言，茶树基因组具有高杂合、高重复和基因组庞大等特点。由中科院昆明植物所牵头的联合科研团队通过基因组建库与测序等一系列关键技术，攻克了茶树基因组测序的难题，在国际上率先获得了高质量的茶树基因组序列。
中国科学院昆明植物所研究员高立志：茶树基因组中，重复序列含量极高，占到了整个基因组的将近90%。在过去的5000万年间，茶树基因组变得十分庞大。测序结果发现，这个茶树基因组序列达到了3.02亿个碱基对，总共从里面注释出36591个编码基因。
研究表明，茶叶中含有茶氨酸、咖啡因、维生素、芳香油和矿物质等很多特征性成分，茶树基因组图谱的成功绘制。对揭示决定茶叶适制性、风味和品质，以及茶树全球生态适应性的遗传基础都有重要促进作用。
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