微波杀青、干燥不需烧煤或烧柴，没有烟雾和灰尘的污染，同时由于实现了茶叶加工的自动化、连续化，避免了常规加工时产生的二次污染。另一方面，微波本身具有杀菌的作用。20世纪40~50年代普遍认为微波杀菌的机理只有热效应。
该理论认为：微波具有高频特性，当它穿透介质时，水、蛋白质、核酸等极性分子受交变电场的作用而取向运动，相互摩擦产生热量，从而导致温度升高，使微生物内的蛋白质、核酸等分子结构改性或失活，从而杀灭微生物。之后的研究则表明微波杀菌效果得益于另一个与温度场同时存在的物理环境——微波电磁场的作用，即非热效应，它是细菌致死的主导因素，由此还获得了一种在较低温度下、充分利用微波交变电磁场杀菌的手段和技术。
