历史上，普洱茶被归人黑茶类。经过长期的生产实践和消费认识，特别是人工发酵普洱茶面市，这种划分引起了有关专家的重视，他们发表了不少建设性的意见。从现行的茶叶分类法、加工工艺和成品品质特征来看，普洱茶同黑茶是有区别的。
云南农业大学园林园艺学院副院长邵宛芳教授和茶学系蔡新教授认为：
第一，从茶叶分类上看，《中国茶经》和《中国茶叶大词典》将现代中国茶叶类别分基本茶类和再加工茶类等。基本茶类是“茶鲜叶经过制造过程形成的不同品质成品茶的类别”，是“依据制造方法和茶多酚氧化程度的不同分为六大茶类，即绿茶、白茶、黄茶、乌龙茶倩茶)、黑茶和红茶”。显而易见，黑茶是基本茶类中的一员，采用鲜叶初制而成。再加工茶类是“以基本茶类的茶叶为原料经再加工而形成的茶叶产品”。基本茶类和再加工茶类划分的前提是鲜叶和成品。云南普洱茶以晒青毛茶为原料，经特殊的再加工而形成，符合再加工茶归属。
第二，一个茶晶的形成是由其加工方法决定的。《茶叶加工学》和《制茶学》等全国高等农业院校教材上都指明，“黑茶初制（加工)，按鲜叶采收、杀青、揉捻(初揉）、渥堆、复揉和干燥等工序制成黑毛茶”，而云南普洱茶加工是用晒青茶经自然发酵陈化或潮水渥堆而成。黑茶渥堆在干燥之前，普洱茶渥堆在干燥之后，两者的制造方法明显不同。
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