种子繁殖方法简单，成本低，后代适应性强。但是，茶树是异花授粉植物，种子后代具有复杂的遗传性，容易产生变异，不易保持良种的优良性状。
茶籽采收
茶籽的采收，茶果采收应按成熟标志及时采收。茶果成熟的标志是：果壳呈绿色，微现裂缝；种壳硬脆，呈现棕褐色；剥开种壳，茶籽饱满。呈乳白色。一般茶区以霜降前后采收茶果较为适宜。
采收茶果，要及时、分批进行，做到先熟先收，晚熟迟收，以保证茶籽质量。虫蛀的茶果，不要采收。不同品种的茶果，要分别采收。采回的茶果，应摊放在干燥和荫凉通风的地方，避免日光曝晒和雨淋。摊放厚度不宜超过10厘米，每天翻动一、两次。三、五天后，茶果开始裂开，可轻轻揉压，使果壳与种子脱离，然后用筛子筛出茶籽。脱壳的茶籽，再适当摊晾，使茶籽含水量降至30%左右。脱壳摊晾的茶籽，去掉夹杂物及虫蛀、霉变者，然后过筛（筛孔直径12毫米）分级后，就可以播种了。
普洱茶播种繁殖
播种时期最好是冬季。冬播比春播发芽率高，出土早，可节省茶籽贮藏所用的费用和人工。
1.浸种催芽，先将茶籽用25-30℃的温水浸4-5天（每天换水两次，将浮在水面的茶籽捞出来淘汰），然后摊于在室内的砂畦上（铺砂厚5-6厘米），厚7-10厘米，上面盖一层5-6厘米厚的细砂，砂上再盖以稻草。室温要保持在25℃左右，每天需洒水一次。催芽室内空气要适当流通。当50%的茶籽露出胚根时，即可播种。
2.播种方法，可采取穴播法和单粒条播法。单粒条播行距20厘米，粒距3-4厘米。穴播行距20厘米，穴距15厘米，每穴播茶籽4-5粒。播种后随即覆土，覆土厚度2-3厘米。要注意的是冬播覆土稍厚，春播覆土宜浅。
普洱茶扦插繁殖
扦插发根的生理基础，茶树营养器官，具有生理上的自然再生作用。即一部分器官丧失或残缺，在适当条件下，可以生长，由丧失或残缺的部分，恢复其原来完整的状态。茶树扦插，是利用茶树营养器官自然再生作用，剪取茶树半木质化枝条上的茎叶段，将下端插入苗床，经过培育，则能生根抽枝，形成独立的新茶苗。
插穗插入苗床，插穗上下切口处附近的细胞，很快产生薄膜，封闭上下切口。在薄膜之下形成愈伤木栓，覆被切口。愈伤木栓具有防止水分散失和微生物侵入等保护作用。这时下端切口在适宜的温度、湿度条件下，经过一段时间，则由形成层和韧皮薄壁组织细胞分裂而产生愈伤组织。同时，从中心柱内鞘，或从髓射线和形成层交叉点发出新根。这就是扦插发根的过程。
插穗中碳水化合物，包括淀粉和糖类的含量，与根的形成有密切关系。通常认为，碳氮比率大，则有利于发根长苗。实验证明，枝叶变成红棕色，达到半木质化时、叶片成熟定型时，碳氮量大，扦插成活率高，发根好，苗木健壮。
扦插发根的生理进程，是与插穗所处的湿度、温度、空气、光照和土壤理化状况有密切关系，它们之间互相影响，互有联系。在扦插育苗的过程中，应妥善协调各生态因子间的关系，充分发挥插穗发根的生理特性。
